Region Alzas nalazi se na krajnjem istoku Francuske i graniči se sa Nemačkom i Švajcarskom. Pokriva teritoriju od 8280 kvadratnih kilometara što ga čini najmanjim regionom u kontinentalnoj Francuskoj. Teritorija je dugačka 190 kilometara i 50 kilometara široka. Na istoku regiona se nalazi reka Rajna, a na zapadu planine Vogezi. Krajolik je mahom šumski i važi za jedan od najlepših u čitavoj Francuskoj. Najviša tačka u regionu je Gran Balon koji se nalazi na 1424 metara, u departmanu gornja Rajna.